北京巴士股份有限公司是于1999年6月18日由北京公共交通控股（集团）有限公司（原北京市公共交通总公司）作为主发起人，联合北京城建集团有限责任公司、北京城市开发集团有限责任公司、北京北辰实业集团公司、北京华讯集团等四家发起人共同发起设立的股份有限公司。公司于2001年1月4日在上海证券交易所发行人民币普通股8000万股，2001年2月16日起在上海证券交易所上市交易。截止至2006年底公司总股本为40320万股。
　　公司自成立以来，主要经营城市和省际公交客运、旅游客运、公交广告以及汽车租赁等相关业务。2006年3月公司按照国务院国资委、证监会等一系列有关方针政策的要求顺利地实施了股权分置改革。
　　2006年9月，为提高公司的盈利能力和长远发展潜力，同时配合北京市公交线网的优化与整合，使城市公交业务充分发挥公益性职能，并减少同业竞争，在市交通委、国资委、财政局、工商局等单位的领导和大力帮助下，根据市委市政府的要求，北京巴士股份有限公司与其控股股东北京公共交通控股（集团）有限公司进行资产置换。置出资产主要为：北京巴士拥有的专线客运分公司、双层客运分公司、新奥客运分公司以及与城市客运业务相关的资产及负债。置入资产主要为：公交集团公司直接拥有的北京北京公交驾驶学校有限公司84%的股权；公交集团公司间接拥有的北京公交捷安汽车租赁有限公司100%的股权；公交集团公司间接拥有的北京八方达客运有限公司47.58%的股权以及公交集团公司间接所有的41部旅游车辆资产。
　　目前公司下设北京巴士旅游分公司、北京公交广告有限责任公司、北京巴士汽车租赁有限责任公司、北京隆源工贸有限责任公司、北京八方达客运有限责任公司、北京市公交汽车驾驶学校有限公司。
　　资产置换实施后，公司不再经营城区客运业务。公司对置换后的业务进行调整与优化，发展壮大郊区长途客运业务，进一步对公交广告资源及业务进行整合与开发，同时大力发展旅游及汽车租赁等服务业务。北京巴士股份有限公司已由一个具有公益性色彩的上市公司，转变成为一个市场化的控股型上市公司。